Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNND2Q9UQB3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms