Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHOC2Q9UQ13 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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