Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSEQ9UL01 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
DSEQ9UL01 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSEQ9UL01 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSEQ9UL01 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSEQ9UL01 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSEQ9UL01 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSEQ9UL01 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSEQ9UL01 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSEQ9UL01 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSEQ9UL01 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSEQ9UL01 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSEQ9UL01 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSEQ9UL01 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSEQ9UL01 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSEQ9UL01 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms