Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDAC9Q9UKV0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms