Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATPIF1Q9UII2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATPIF1Q9UII2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms