Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms