Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJB4Q9UDY4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms