Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD2Q9UBB5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD2Q9UBB5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD2Q9UBB5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD2Q9UBB5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MBD2Q9UBB5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms