Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD7Q9P2D1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms