Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CABP1Q9NZU7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CABP1Q9NZU7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms