Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPG21Q9NZD8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms