Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC9

SMARCAL1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAL1Q9NZC9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCAL1Q9NZC9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCAL1Q9NZC9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms