Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM53CQ9NYF3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms