Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VNN3Q9NY84 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms