Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDE1Q9NXR1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDE1Q9NXR1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms