Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM9Q9NXL9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms