Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
INTS9Q9NV88 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
INTS9Q9NV88 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms