Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTLC3Q9NUV7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms