Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SAMSN1Q9NSI8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms