Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SALL1Q9NSC2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms