Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms