Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FBXO6Q9NRD1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXO6Q9NRD1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms