Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BIN3Q9NQY0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BIN3Q9NQY0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms