Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTAC1Q9NQ79 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTAC1Q9NQ79 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms