Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLRC4Q9NPP4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRC4Q9NPP4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLRC4Q9NPP4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms