Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUFT1Q9NNX1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUFT1Q9NNX1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms