Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM8AQ9HCN3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM8AQ9HCN3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms