Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRDE2Q9H7Z3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRDE2Q9H7Z3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms