Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD3Q9H7E2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TDRD3Q9H7E2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms