Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms