Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRCC1Q9C099 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRCC1Q9C099 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRCC1Q9C099 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRCC1Q9C099 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRCC1Q9C099 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms