Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM55Q9BYV6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms