Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PCGF6Q9BYE7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCGF6Q9BYE7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms