Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC4A5Q9BY07 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A5Q9BY07 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms