Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms