Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BBS2Q9BXC9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms