Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
REPIN1Q9BWE0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms