Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB2BQ9BVA1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB2BQ9BVA1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms