Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP8Q9BV40 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms