Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM208Q9BTX3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM208Q9BTX3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms