Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C2orf88Q9BSF0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C2orf88Q9BSF0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms