Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3CQ99985 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms