Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED2Q99967 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED2Q99967 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms