Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NPAS2Q99743 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms