Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF3CQ99613 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF3CQ99613 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms