Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPXM1Q96SM3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms