Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TGS1Q96RS0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms