Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARXQ96QS3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARXQ96QS3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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