Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85AQ96PX6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms