Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms